最为重要的是由卢光时为首，即将重新组建的锦衣卫！
前明鼎鼎大名的锦衣卫，其实职权以缉捕谳狱、侍卫皇帝及城市管理为首要职掌，北镇抚司官专理诏狱，锦衣卫各司房处理的案件以京师地区一般犯罪居多。
至于特权监察机构、特务机关和秘密警察机关指的是东厂。
西厂更是牛掰，可侦查民臣的言行，并可以对疑犯进行拘留、用刑，把监狱以及法庭混为一体，而且可随意逮捕朝中大臣，可不向皇帝奏请！
朱子明设立的锦衣卫是取其精髓的产物，首先，锦衣卫可独立行使监察权，调查权、拘捕权，不受府县机关、社会团体和个人的干涉。
可对具有实证的重犯进行拘留、用刑。可监视百姓、百官及各个政府部门，可对具有实证的贪腐、犯罪的官员进行举报。还需承担缉捕罪犯、传递文书、传宣诏令、卧底间谍、暗杀、特种作战等任务！
锦衣卫统领三人分别为：指挥使一人、副指挥使两人。下设五司：文书司、监查司、辑捕司、暗影司、特战司。各司根据需求设千户、百户、总旗、小旗等职位。
首任指挥使就是由卢光时担任！并负责组建锦衣卫各司！复明军、护安队、农会、县镇官员等人任由锦衣卫挑选！
看着领命而去的卢光时，朱子明又召来陈文辅，是时候正式改建政治体系了，复明军的麾下已经有了两县之地，官员的等级及任用也该有个章程了。
朱子明定下的组织体系如下：农会、法院、检查院和即将成立的工会将独立于政府机关之外，不受任何官员及社会团体的干涉！直接由中央管理。
县级政府官员有知县一人：主要掌管一县政治、经济、官员任用等事务，配秘书一名。县尉一人：主管一县的治安、拘捕、查案等事务，全县的护安队都归其管辖。主簿一人：文书、税收、户籍、仓库等事务。典吏长一人：统管全县衙典吏、统管全县衙的后勤等事务。
镇级政府官员有镇长一人，主簿一人。村级设有村长一人，主簿一人。
法院与检查院皆设立在县里，全县的百姓有何案情皆可在法院起诉。目前法院只有一名法官和两名典吏，法律更是简单粗暴！杀人偿命，犯罪判刑，违法罚款！检察院也是只有一名检察长和两名典吏，护安队提交的案件，将先由检察院检查后才可向法院提起诉讼。
三权分立的司法机构，经过兔子的验证后，朱子明可以尽管抄来用。
最关键的是农会和工会，这是保证农民阶级和工人阶级利益的重要机构！朱子明治下的所有农民，必须加入农会，听从农会的统一调度和管理！打井挖渠，救灾抗险是农会的基本义务！农会更是协助官府收取农税的重要渠道。
相对应的所有工人也都必须加入工会！工会组织将代表职工的利益，依法维护职工的合法权益。不是后世兔子家的空架子，朱子明打算玩真的！
所有用工主体必须和工人签署劳动协议，必须约定好工资数额、工作时长、休沐日期等内容，劳动协议还需在工会备案。用工单位必须将工人工资支付至工会，再由工会发放给工人！当工人和用工单位没有直接的利益接触时，发生的压榨就会少很多。所有雇佣未加入工会职工的用工单位，全部视为违法！
所有克扣职工工资的，不提供劳动安全卫生条件的，随意延长劳动时间的，侵犯女职工和未成年工特殊权益的违法行为，都会被工会起诉至法院进行处罚！
所有用工单位都必须为职工在工会缴纳一笔额外的保险费用，职工若出现伤残等现象，将由工会保险兜底而不至于因失去劳动能力而被社会抛弃。
在朱子明的设想里，工人阶级是必不可缺少的一部分！工人阶级的利益可以当作国家利益来对待！压榨职工，打骂职工，侵犯职工的行为绝不可容忍！工会和农会的领导皆由全体会员选举出来！只有真正来自基层的人，才会为自己阶级的民众谋取利益！
工人则需要交纳一定的税来为复明军做出应有的贡献，月收入五两以下的不收税，月收入五两以上十两以下的缴纳十分之一的月俸税，月收入十两以上二十两以下的缴纳十分之二的月俸税，月收入三十两以上的缴纳十分之三的月俸税！
顾岩也奉命开始轰轰烈烈的进行起了大扩军，并同时挑选人员组建参谋部！顾岩任总参谋长，提拔了3名参谋员赴三个团任职，招收了50名指导员赴每营每连进行任职！
指导员和参谋员与同部队的团长、营长和连长同级别，不同的是，指导员和参谋员分责的是思想政治工作。
举个例子，在一个连里，以后会有两个长官，一个是连长，一个是指导员。两人同级，且没有高低之分。按分工来说，连长抓训练，指导员抓思想政治工作。在实际工作中，二人是分工不分家，连长要协助指导员做政工；指导员要协助连长抓训练。
有了参谋部的思想灌输，完全确保了复明军是属于朱子明的军队！而不是属于某个将领的私兵！也完全摊薄了将领的权利，除了带兵打仗与训练外，几乎是没有实权，就算提拔个队长，也得经过指导员的同意。
在军政体系完全改制后，朱子明还设立了直属“中央”的内阁，下辖护安部、财政部、科学技术部、教育部等机构。四部的部长直接由内阁管辖，内阁实行总理负责制，为什么要叫总理，而不是阁老？因为阁老容易让人膨胀！总理是个新职位，明显区别于以前的阁老。
领命回到竹堑县县衙的陈文辅，立马大刀阔斧的干了起来，先擢升苗仿为竹堑县知县、再擢升县护安队队长晋升为县尉，再擢升之前工作最好的衙役为典吏长，又开始对外公开招募精通算数的人为主簿！他自己则走马上任组建内阁并出任内阁总理！