剿灭刘香后，郑芝龙派郑芝豹、郑芝凤和施大瑄到广州府新安县的香港建立水寨，率部分战船继续在广东沿海巡航，打击匪患。自己率南海水师主力返回到金门驻地，根据皇帝的旨意继续进行台湾的屯垦开发。
自天启七年以来，闽南一带遭遇大旱，粮食颗粒无收，流民遍地。当时郑芝龙为了开发台湾进行屯垦，就招募流民，出资补助购买种子、农具和耕牛等等。但当时都是私下行为，受到官府和朝廷水师的阻挠，招募规模很难扩大。
现在，郑芝龙已成为朝廷命官，且皇帝也要求他配合熊文灿迁徙人口，大力开发建设台湾。于是，官府在浙江、福建、广东沿海发布通告，鼓励百姓前往台湾定居屯垦，直接以垦荒分田地，资助种子、农具和耕牛，并承诺三年免税。
皇帝下旨建立福建海关后，熊文灿将福建海关衙门设立在漳州府海澄县，并正式将月港设为通商口岸开放。熊文灿雇佣大量船只，将流民和自愿前往台湾的百姓从月港运往台湾。郑芝龙的船队则日夜跟随护航，也协助运送人员和物资到台湾岛。
郑芝龙运送货物到达台湾岛南社，上岸视察情况，南海水师监军处主事张桃（虚构）也随之上岸。
在南社，张桃见到屯垦的百姓和南海水师的士卒时常会与荷兰人做交易，买来一种乌漆嘛黑的膏状物，然后在烟枪上点燃，躺在床上吸食。张桃询问过后才知道，此物名为“大烟”，点燃后吸入可使人仿佛置身极乐。
张桃也不以为然，随手就把台湾岛这种“风土人情”记在奏本上，呈给了皇帝。
南海水师监军处此次传回的奏本有十几本，王体乾将每一本都细细阅读过，挑选出一部分重要的军情呈交皇帝，另外一些他认为无足轻重的就闲置一旁不再理会，大烟奏本也在其中。
一晚，王体乾散值后，监军处一片漆黑。房梁上一道黑影落下，轻轻点地，无声无息。黑影一本本翻看闲置奏本，最后挑出几本，将所有地方细细恢复原状，抹除痕迹，便翻上房梁消失在黑暗之中。
第二天一早，朱由校来到御书房便看到案上平铺的奏本。
“哼！这个王体乾也是年纪大了，脑子思维都跟不上变化了，监军处该换人了。”
朱由校合上奏本正暗想着。
魏忠贤缓缓步入，躬身道：“皇爷，户部尚书郭允厚、侍郎毕自严、毕懋良求见。”
“让他们进来吧。”
“臣等参见陛下。”
朱由校抬头看向下首三人。郭允厚自从太仓国库大大充盈、各处财政补足后，整个人都精神饱满、容光焕发；左侧一人是接替南居益任左侍郎的毕自严（字景会）；右侧一人是毕懋良（字师皋），是工部右侍郎毕懋康（字孟侯）的堂兄。
朱由校慢条斯理，道：“三位爱卿，今日是发生何种大事？怎么整个户部都跑来找朕呢？”
郭允厚道：“陛下，遵照您的旨意，由朝廷专营的作坊、府库、国榷等已经分类整理好。”说着呈上一本奏折。
“郭爱卿稍候。”朱由校点点头，转头对魏忠贤道：“召信王入宫见朕。”
朱由校继续问：“两位毕爱卿所为何事？”
毕自严抢先道：“皇上！这毕懋良又来缠着臣要钱银！臣不给还赖在臣家中不走！着实可恶！”
毕懋良道：“陛下，是您说只要军器局需要，臣可以尽管开口要钱，是毕自严这老家伙不给！军器局那边又嗷嗷待哺，孟侯还待在臣家中等着臣拿钱回去呢！臣没未拿到钱无颜见孟侯，只能在景会大人家中待着了。”
朱由校想笑，但这皇帝的包袱也难以放下，强装着道：“毕卿家……额……景会卿家，户部前两年收入颇丰啊，军器局花销大，师皋卿家要钱你给他不就好了嘛。”
毕自严道：“陛下，之前太仓银库的确存银不少，但是您这两年大搞军改、提高军队待遇，而各地大搞税赋改革，税银不仅未见增长，还要太仓不断往外补贴，银库已日益见底。去年陛下叮嘱已是特意提高了给工部的预算，后面军器局超支，又数次追加，现在军器局已超支三倍啦！臣饶是再精打细算也再拿不出钱给他了呀！”
毕自严说着竟然开始掩面抹起了眼泪。
朱由校顿时有点脸红，因为是自己偏心工部，怕有人阻挠而特意安排毕懋良到户部，方便为军器局争取预算的，不知不觉原来已经超支这么多了，户部也是不容易。
朱由校赶忙道：“景会卿家勿忧，这事是朕有欠考虑，您先回去处理其余公务，这事朕来处理。”
毕自严闻言，脸色马上恢复正常，脸上哪来一滴泪！
“臣谢陛下，臣告退！”
看着毕自严离去，朱由校一头黑线：“这老家伙，装得不错啊！”
朱由校问：“毕卿家，军器局还需多少预算？”
“最低还需二百万两，上不封顶！”毕懋良伸出两根手指淡然说道。
朱由校也想掩面哭泣，只好摆摆手：“行吧，这笔钱先由内帑拨给，毕卿家你先去忙吧。”
毕懋良离去，信王朱由检跟着魏忠贤来到御书房。
朱由校问魏忠贤：“内帑还有多少存银？”
魏忠贤拿出内承运库账本，道：“内帑还有存银五千五百三十五万八千余两。”
朱由校点头：“调拨两千万两给户部，再拨四百万两给军器局。”
“老奴遵旨！”
郭允厚激动得跳起来：“臣谢陛下！”
朱由校白了他一眼，道：“这两千万两可不是白给你的，接下来户部要整合官营作坊、府库和国榷，出资成立‘大明贸易集团’，专事工商业，调节控制对国家朝廷重要的产业，例如粮食、食盐、矿业、医疗等等。一是可以为国库赚取钱银，以充财政；二是可以通过调控经济，治理大明。”
朱由校看向朱由检：“这大明贸易集团第一任总经理就由你担任了。”
朱由检一脸懵逼：“我？臣弟不善经营之道，怎可胜任？”
朱由校笑道：“无妨，郭爱卿会辅助你的，朕不是要你经商赚钱，经商会计人才可以从民间聘任、从科学院选取，只要你帮朕监督管理、确保集团正常运营即可。朕的弟弟，身为大明亲王，现在正是你施展才华、报效国朝的时候啊！”
朱由检听罢，一脸严肃：“臣弟定不负皇兄厚望！”
朱由校忽然想到一个人，问道：“弟弟，你的随身太监可曾进宫？”
“正在门外伺候。”
“是叫王承恩？”
“正是。”
“你把此人让予朕如何？你想要什么，朕跟你交换。”
朱由检忙道：“臣弟惶恐！皇兄身为天子，一言九鼎，想要一个小太监臣弟自然奉上，无须交换。”
朱由校点点头：“好好好，不愧是吾弟！这不是交换，这是赏赐，至于赏赐何物，日后再揭晓。”
“臣弟谢皇兄隆恩！”
不久，朱由校以“年老体衰，当颐养天年”为由将王体乾解职，赐予金银田地，命其还乡。
王承恩升为御马监掌印太监，兼监军署提督太监。