当时，关胜等四将领兵飞马杀到乌龙岭上，正好迎上了石宝的军马。关胜在马上大声喝道：“贼将怎敢杀我弟兄！”石宝见是关胜，无心恋战，便退上岭去。白钦则前来与关胜交战，但两人斗不到十个回合，乌龙岭上又鸣锣收军。关胜没有追赶，岭上的军兵自乱阵脚。原来，石宝只顾在岭东厮杀，却没提防岭西已被童枢密率领的大军杀上岭来。宋军中的大将王禀与南兵指挥景德交战，斗了十几个回合后，王禀将景德斩于马下。接着，吕方、郭盛率先奔上山来夺岭，但还没到岭边，山头上就飞下一块大石头，将郭盛连人带马打死在岭边。
关胜望见岭上大乱，知道岭西有宋兵上岭了，于是急忙召集众将，一齐杀上去。两面夹攻之下，岭上展开了混战。吕方正好迎上了白钦，两人交手厮杀。斗不到三个回合，白钦一枪刺来，吕方闪身躲过，白钦那条枪从吕方肋下刺空，而吕方的戟却被白钦拨得倒横。两将在马上各施展不得，都弃了手中兵器，在马上互相揪住。这时正好遇到山岭险峻处，那马如何站得稳？二将用力过猛，结果连人带马都滚下岭去，一同摔死在那岭下。
这边关胜等众将步行杀上岭来，两面都是宋兵，已经杀到岭上。石宝看见两边都没有去路，唯恐被捉了受辱，于是用劈风刀自刎而死。宋江众将夺了乌龙岭关隘后，关胜急忙派人报知宋先锋。
与此同时，睦州上溜头又有军马杀来，上下夹攻。江里水寨中的四个水军总管见乌龙岭已失守、睦州已陷落，都弃了船只逃过对江去。结果被隔岸的百姓生擒了成贵、谢福两人并解送入睦州；而翟源、乔正两人则逃走不知去向。宋兵大队回到睦州后由宋江出城迎接童枢密、刘都督入城。
安顿好军营之后出榜招抚军民恢复生产生活。南兵投降的人数不计其数。宋江将仓库中的粮米全部散发给百姓让他们各自回归本业重新成为良民。同时将水军总管成贵、谢福剖腹取心以祭祀兄弟阮小二、孟康以及在乌龙岭阵亡的所有将佐的亡灵。接着又命令李俊等水军将领管领了许多船只把俘虏到的贼首和伪官解送到张招讨的军前去了。
宋江又因为折损了吕方、郭盛两位将领而惆怅不已；于是按兵不动等待卢先锋的兵马一同进攻清溪。有诗为证：“古睦封疆悉已平行宫滚滚火烟生。几多贼将俱诛戮准拟清溪大进兵。”这里暂且不说宋江在睦州的屯驻情况。
却说副先锋卢俊义自从在杭州分兵之后统领着三万人马以及本部下的正偏将佐共二十八人引兵从山路向杭州进发。他们经过临安镇这个钱王故都时走近了昱岭关前。而守关把隘的却是方腊手下一员大将绰号叫小养由基的庞万春。此人是江南方腊国中第一个擅长射箭的人。他带领着两员副将一个叫雷炯一个叫计稷。这两个副将都能拉开七八百斤的强弩并且各会使用一枝带刺的骨朵作为武器。他们手下一共有五千人马。这三人一同守把在昱岭关隘处得知宋兵分派副先锋卢俊义引军到来时已经做好了迎战的准备只等宋军靠近了。
卢俊义的先锋军马即将接近昱岭关前，他先派遣史进、石秀、陈达、杨春、李忠、薛永六员将领，带领三千步兵前去侦察。这六人都骑着战马，其余的都是步兵，一路蜿蜒前行到关下，却没有遇到一个敌军。史进在马上心生疑虑，和众将商议。话还没说完，他们已经到了关前，看到关上竖着一面彩绣白旗，旗下站着小养由基庞万春。庞万春看到史进等人，大笑并骂道：“你们这伙草贼，只配在梁山泊里住，接受宋朝的招安诰命，怎么敢来我这里装好汉！你们可曾听说过我小养由基的名字？我听说你们这伙人里有个叫小李广花荣的，让他出来和我比箭。先让你们看看我的神箭！”话还没说完，嗖的一箭射去，正中史进，史进摔下马去。其余五将急忙上前抢救，上马便回。这时，山顶上一声锣响，左右两边的松树林里同时放箭。五员将领顾不得史进，各自逃命而去。转过山嘴，对面两边山坡上，一边是雷炯，一边是计稷，那弩箭如雨一般射来。即使再有十分英雄气概，也躲不过这般的箭矢。可怜这六员将领，都如南柯一梦般死去。史进、石秀等六人，没有一个逃脱，全都被射死在关下。
三千步兵，只剩下百余名小军逃回来，向卢俊义报告了此事。卢俊义听后大惊，如痴似醉，呆了半晌。神机军师朱武便劝道：“现在先锋如此烦恼，会耽误大事。我们可以另商量一个计策去夺关斩将，报此仇恨。”卢俊义道：“宋公明兄长特意分给我许多将领和士兵，但现在还没有赢得一场胜利，就先折了六员将领和三千士兵，只剩下百余人回来。这样我怎么有脸去歙州相见！”朱武答道：“古人有云：天时不如地利人和。我们都是中原山东、河北人氏，不习惯水战，因此失了地利。我们需要找到本地的乡民来指引路径，才能知道这里的山路曲折。”卢俊义道：“军师说得极对。那么应该派谁去侦查路径呢？”朱武道：“依我之见可以派鼓上蚤时迁去。他是个擅长飞檐走壁的人很适合去山中寻路。”卢俊义随即召唤时迁前来并交代了任务。时迁领了命令带了干粮和腰刀离寨而去。
时迁朝着深山的方向走去寻找路径。走了半天天色已晚他来到一个地方远远地看到一点灯光。时迁道：“有灯光的地方一定有人家。”他趁着黑夜摸到灯光明亮的地方一看原来是个小庵堂里面透出灯光来。时迁来到庵前钻进去看时见里面坐着一个老和尚在诵经。时迁便敲他的房门那老和尚叫来一个小和尚来开门。时迁进去后向老和尚行礼。老和尚问道：“客官不必多礼。现在这里是万马千军厮杀的地方你怎么会走到这里来？”时迁回答道：“实不相瞒师父我是梁山泊宋江部下的一个偏将时迁。现在奉圣旨来剿收方腊但昨晚在昱岭关上被守关的贼将用乱箭射死了我方六员首将无法过关特地派我来寻找路径探听有没有小路可以过关。现在我从深山旷野中找到这里希望师父能指点迷津告诉我有没有小径可以私越过关如果有的话我一定会重重报答。”
那老和尚说道：“这里的百姓都被方腊残害无不对他怨恨深重。老僧我也靠这里的村民施舍斋粮度日。现在村里的人都逃散了老僧我也无处可去只能在这里等死。今天幸好你们天兵到此万民有福了。将军你来收服这些贼人与民除害老僧我只是不敢多嘴怕被贼人知道。现在你既然是天兵派来的头目那么多嘴也无妨。只是我这里并没有路可以过得关去直到西山岭边才有一条小路可以过关上只怕最近也被贼人筑断了过不去。”
时迁问道：“师父，既然有这条小路可以通到关上，那不知道它能不能通到贼人的寨子里呢？”老和尚回答道：“这条小路一直通到庞万春寨子的背后，下岭去就是过关的路了。但我担心贼人已经用大石块把路给筑断了，那样就很难过去了。”时迁说：“没关系，只要有路，就不怕他们筑断，我自有办法。既然知道了路，我就回去报告主将，然后再来酬谢你。”老和尚嘱咐道：“将军见到外人时，请不要提及我。”时迁应道：“我是个精细的人，不会说出师父你的。”
当日时迁辞别了老和尚，直接回到寨中，向卢俊义报告了此事。卢俊义听后大喜，便请军师朱武商议取关的策略。朱武道：“如果有这条路，那就太好了。我们可以轻易地夺取昱岭关。”接着他建议再派一个人和时迁一起去完成这件大事。时迁问：“军师要做什么大事？”朱武道：“最要紧的是放火放炮。你们需要带上火炮、火刀、火石，直接去他们寨子背后放起火炮来，这就是你的大事了。”时迁应道：“如果只是要放火放炮，没有别的任务，那就不需要再派别人同去了，我一个人就可以。即使再派一个人同去，他也跟我走不了飞檐走壁的路，反而会误了时间。如果我去那里行事，你们这里怎么到关边呢？”朱武道：“这却容易。他们的埋伏也只能用一次。我们现在不管他有没有埋伏，只要是遇到树木稠密的地方，就放火烧过去，任他埋伏也没用。”时迁赞同道：“军师高见。”
当下时迁收拾了火器用具，背上火炮来向卢俊义辞行。卢俊义又让时迁带了二十两银子和一石米送给老和尚，并让一名军校挑着送去。午后时分，时迁带着军校挑着米再次找到老和尚的庵堂将银子和米都交给了他，并分付小军自回寨去，然后又来请求老和尚指引路径，并让小和尚引他去。老和尚道：“将军稍等，夜深了再去吧，白天恐怕会被关上的人发觉。”于是老和尚备了晚饭款待时迁。到了夜里，他让小和尚引路送时迁过去，并叮嘱小和尚送完后即回不要让人发觉了。
当时小和尚领着时迁离了草庵便朝深山里寻路而去。他们穿过了密林攀过了藤葛走过了数里山径野坡。在月色微明中他们来到了一处险峻的山岭前看到石壁巍峨堆叠着大石筑成了高高的墙壁仿佛无法逾越一般。然而远远地他们却发现了一个小路口似乎可以通向那边的大路。小和尚告诉时迁：“将军关已经望见了石叠墙壁那边就是。只要翻过那石壁就有大路可走。”时迁道：“小行者你回去吧我已经知道路了。”于是小和尚便独自回去了。
时迁展现出了他飞檐走壁、跳篱骗马的绝技，轻松地越过了这些石壁。他向东望去，只见林木之中火光冲天，原来是卢俊义和朱武等人拔寨而起，一路上放火烧着，直朝关上来。他们先派了三五百军人在路上清理尸首，沿着山岭放火开路，使得埋伏的敌军无处藏身。
昱岭关上的小养由基庞万春得知宋兵放火烧林开路的消息后，对部下说道：“这是他们进兵的方法，让我们的伏兵无法施展。我们只要牢守此关，任他们如何也过不了！”他带着雷炯、计稷等人都来到关前守护。
却说时迁一步步摸到关上，藏在一棵大树的茂密枝叶中，偷看庞万春、雷炯、计稷等人都将弓箭踏弩准备好，伏在关前等待宋兵。当看见宋兵渐渐接近关下时，中间林冲、呼延灼立马在关下大骂：“你们这些贼将竟敢抗拒天兵！”南军庞万春等人正要放箭射击时，却没提防时迁已经在关上了。
时迁悄悄地溜下树来转到关后看见两堆柴草便摸进去取出火刀、火石发出火种把火炮放在柴堆上。他先点燃了一些硫黄、焰硝去烧那边的草堆然后又来点燃这边的柴堆。当他刚刚点燃火炮时就拿着火种直爬上关屋脊上去。他点燃了关屋两边柴草堆里的火一起烧起来火炮震天价响。关上的众将不杀自乱发起喊来众军都只顾逃跑那里还有心思来迎敌。
庞万春和两个副将急忙来关后救火时时迁就在屋脊上又放起炮来。那火炮震得关屋也动吓得这南兵都抛弃了刀枪弓箭、衣袍铠甲尽都往关后逃奔。时迁在屋上大叫道：“已有一万宋兵先过关了你们赶快投降免得送死！”庞万春听了惊得魂不附体只管跌脚。雷炯、计稷也惊得麻木了动弹不得。
林冲、呼延灼首先冲上山去早早赶到了关顶。众将都要争先一齐赶过关去三十馀里追着南兵。孙立生擒得雷炯魏定国活拿了计稷单单只走了庞万春。手下军兵擒捉了大半。宋兵已到关上屯驻人马。
卢俊义得了昱岭关后厚赏了时迁将雷炯、计稷在关上割腹取心享祭史进、石秀等六人并收拾他们的尸骸葬于关上。其余的尸首都进行了烧化处理。
次日卢俊义与众将一同披挂上马。一方面行文向张招讨报告已经攻占了昱岭关；另一方面引军前进继续追赶敌军直至歙州城边下寨安营。
原来歙州的守将是皇叔大王方垕他是方腊的亲叔叔与另外两员大将共同守卫歙州。这两员大将一个是尚书王寅一个是侍郎高玉。他们统领着十数员战将和两万大军牢牢守住歙州城。
王尚书原本是本州山里的石匠出身他擅长使用一条钢枪并且有一匹好马名叫转山飞。那匹战马能够轻松地登山渡水就像走在平地上一样。而高侍郎则是本州的士人故家子孙他会使用一条鞭枪。因为这两个人都颇通文墨所以方腊加封他们为文职官爵并赋予他们兵权。
当小养由基庞万春败回到歙州后他直接来到行宫向皇叔方垕报告了战况：“我们被当地的居民出卖他们引导宋兵从小路私自过关因此我们的军队被打散了无法抵挡宋兵的进攻。”皇叔方垕听了之后大怒他痛骂庞万春道：“这昱岭关是歙州的第一道重要关隘现在被宋兵突破了他们早晚都会打到歙州来我们怎么跟他们对抗？”
王尚书上前奏道：“主上请息怒。自古道：‘非干征战罪天赐不全功。’现在请殿下暂时饶恕庞将军的罪过并让他立下军令状引军首先出战迎敌如果能够杀退宋兵就免去他的罪过；如果战败了再两罪并罚。”方垕同意了王尚书的建议拨给庞万春五千军马让他出城迎敌如果得胜再回来报告。
卢俊义在度过昱岭关之后，迅速催兵直赶到歙州城下。当天，他与诸位将领一同对歙州城发起了猛烈的攻击。城门开启，庞万春率领军队出来迎战。两军迅速列成阵势，庞万春挺身而出，站在阵前挑战。
宋军队伍中，欧鹏骑马冲出，手握铁枪，与庞万春交战。然而，两人交战不过五个回合，庞万春便败走。欧鹏立功心切，纵马紧追不舍。庞万春突然转身，背射一箭。尽管欧鹏手段高强，成功绰住了箭，但他却没有提防庞万春能放连珠箭。就在欧鹏绰住第一支箭，放心继续追赶的时候，弓弦再次响起，庞万春的第二支箭射来，欧鹏躲闪不及，被射中落马。
城上的王尚书和高侍郎见欧鹏落马，庞万春得胜，便引领城中军马一齐冲杀出来。宋军大败，被迫退回三十里外扎寨安营。在整点兵将时，发现乱军中又折损了菜园子张青。孙二娘见丈夫死去，伤心欲绝，她命令手下军人找到张青的尸首进行烧化，并痛哭了一场。
卢俊义看到这种情况，心中十分郁闷，他思量着这不是个好办法。于是，他与朱武商议道：“今日进兵又折了两员大将，如此下去该如何是好？”朱武回答道：“输赢胜败乃兵家常事；死活交锋则是人之分定。今日贼兵见我等退回军马，必然自逞其能。我料他们今晚定会乘势来劫寨。我们可以将军马众将分调开去四下埋伏，中军缚几只羊在那里作为诱饵，如此这般整顿准备。”
朱武接着叫呼延灼引一支军在左边埋伏、林冲引一支军在右边埋伏、单廷圭和魏定国引一支军在背后埋伏，其余偏将则各自在四散的小路里埋伏。夜间贼兵来时只要看中军火起为号令四下里便各自捉人。卢俊义都一一安排妥当后各自去守备。
且说南国的王尚书和高侍郎两人都颇有些谋略。他们与庞万春等人商议后上启皇叔方垕道：“今日宋兵败退回去三十余里屯驻营寨空虚军马必然疲倦。我们何不乘势去劫他们的寨栅必然能获全胜。”方垕听了觉得有理便道：“你们众官从长计议如果觉得可行便去行事。”
高侍郎道：“我便和庞将军引兵去劫寨尚书与殿下紧守城池。”当夜二人披挂上马引领军兵前进。为了不惊动宋军他们让马摘下了銮铃军士们也都衔枚疾走。他们一直前进到宋军的寨栅前看见营门未关但却不敢擅自进入。
初时他们听得更点分明但向后更鼓便打得乱了。高侍郎觉得有异勒住马道：“不可进去。”庞万春问道：“相公为何不进兵？”高侍郎答道：“听他们营里更点不明必然有诈。”庞万春却道：“相公你误会了。今日他们兵败胆寒必然困倦因此打更不明。相公何必多疑我们只管杀进去便是。”高侍郎听了觉得也有道理当下便催军劫寨大刀阔斧地杀将进去。
然而他们进入寨门后直到中军都不见一个军将却只见柳树上缚着数只羊羊蹄上拴着鼓槌在那里打鼓因此更点不明。两人劫了个空寨心中自慌急叫：“中计了！”回身便走。但此时中军内却已火起只见山头上炮响又放起火来四下里伏兵乱起一齐杀将拢来。
两人冲开寨门奔走却正迎着呼延灼。呼延灼大喝道：“贼将快下马受降免你一死！”高侍郎心慌意乱只想脱身无心恋战被呼延灼赶进去手起双鞭齐下打得他脑袋骨碎裂而亡。庞万春则死命撞透重围侥幸逃脱性命。然而在他正逃之间不提防汤隆伏在路边被他一钩镰枪拖倒马脚活捉了过来。
此时众将已都在山路里赶杀南兵直到天明才都回到寨里来。卢先锋已先到中军坐下随即进行赏赐不在话下。
当卢先锋下令点本部将佐时，发现丁得孙在山路草丛中被毒蛇咬伤，毒气已入腹，无法救治而死。为了祭奠欧鹏、史进等亡将，卢俊义下令将庞万春剖腹挖心，并将首级送往张招讨军前。
第二天，卢先锋再次率领诸将进兵到歙州城下。他们发现城门未关，城楼上也没有军士和旌旗。单廷圭和魏定国两人渴望夺得头功，率先引军冲入城中。然而，当他们冲进城门后，却遭遇了陷阱。原来，王尚书见折了劫寨的人马，便假装弃城而逃，实际上在城门内掘下了陷坑。单廷圭和魏定国并未提防，结果连人带马都陷入了坑中。坑两边埋伏的长枪手和弓箭手立刻上前戳杀，导致两人都丧命于坑中。
卢俊义见又折了两员大将，心中愤怒不已。他急忙命令前部军兵用土块填平陷坑，同时与南兵展开激战。在战斗中，宋兵将南兵人马杀死后填入坑中。卢俊义亲自跃马冲入城中，正好迎上了皇叔方垕。两人交战仅一个回合，卢俊义便愤然挥出平生之威，一刀将方垕剁于马下。城中的南兵见状纷纷打开西门逃跑。宋兵众将则齐心协力向前追杀南兵。
在逃跑的过程中，王尚书撞上了李云并与其展开厮杀。李云是步战高手，但王尚书却骑马挺枪向前冲来。结果李云被王尚书的马撞倒踏伤。石勇见李云遇险，急忙前来救援。然而王尚书的枪法神出鬼没，石勇无法抵挡最终被王尚书一枪刺死。此时城里又冲出了孙立、黄信、邹渊、邹润四将截住王尚书厮杀。尽管王尚书勇猛力敌四将并无惧色，但最终还是被林冲赶到并与其他四将一起将其乱戳杀死。可怜这位南国的尚书将领今日命丧黄泉。五将取下王尚书的首级后飞马献给卢先锋。
卢俊义在歙州城内的行宫安顿下来后立刻出榜安民并将军马屯驻在城里。同时他派人向张招讨报捷并驰书转达给宋先锋知会进兵的事宜。另一方面宋江等兵将在睦州屯驻等候各路人马齐集一同攻打贼洞。当他们收到卢俊义的书信得知歙州已经平复并且军将已到城中屯驻后非常高兴并专候进兵同取贼巢的命令。然而他们也得知了史进、石秀、陈达、杨春、李忠、薛永、欧鹏、张青、丁得孙、单廷圭、魏定国、李云、石勇等十三位将佐阵亡的消息感到非常伤心和烦恼。军师吴用劝慰宋江道：“生死有命富贵在天，主将不必过于悲伤而损伤身体，还是请理料国家大事为重。”宋江虽然明白这个道理但仍然不由得感到伤感。他回想起当初石碣天文所载的一百零八人如今却渐渐凋零损失了许多手足兄弟。吴用继续劝慰宋江并建议他回信给卢先锋约定日期起兵攻取清溪县以继续推进征讨方腊的大业。
先不提宋江给卢俊义回信，约定日期一同进兵的事情。却说方腊在清溪的帮源洞中设立朝廷，与文武百官商议如何应对宋江的军队。这时，有从西州败逃回来的残军来报告说：“歙州已经失陷，皇叔、尚书、侍郎等人都已阵亡。现在宋江的军队分两路攻来，目标直取清溪。”方腊听后大惊，立刻召集两班大臣商议对策。
方腊说：“你们众位卿家都受了我的官爵，共同占据州郡城池，共享富贵。谁想到现在被宋江的军队席卷而来，州城都失陷了，只剩下清溪的皇宫。现在听说宋江的军队两路攻来，我们应该如何迎战？”这时，左丞相娄敏中出班奏道：“这次宋江的人马已经逼近我们的内苑，宫廷也难以保守。但是我们的兵力微弱，将领稀少。陛下如果不亲自出征，恐怕兵将们不会尽心尽力去战斗。”方腊说：“你说得对。”随即传下圣旨，命令三省六部、御史台官、枢密院、都督府的官员以及二营金吾、龙虎等大小官僚都跟随他御驾亲征，决一死战。
娄丞相又问：“应该派哪位将帅担任前部先锋？”方腊说：“让殿前金吾上将军、内外诸军都招讨皇侄方杰担任正先锋，马步亲军都太尉、骠骑上将军杜微担任副先锋，带领帮源洞大内的护驾御林军一万五千人和三十多名战将前进。遇到山就开路，遇到水就架桥，招兵买马，一路征进。”原来这方杰是方腊的亲侄儿，是歙州皇叔方垕的长孙。他听说宋兵的卢先锋杀了他的祖父，正要来报仇，所以愿意担任前部先锋。这方杰平生学习武艺，擅长使用一条方天画戟，勇猛无比。而杜微原本是歙州山中的铁匠，会打造兵器，也是方腊的心腹之人。他擅长使用六口飞刀，只是擅长步战。
方腊又另下一道圣旨，派御林护驾都教师贺从龙带领一万御林军去迎战歙州的卢俊义军马。有诗为证：八郡山川已败倾，便驰黄屋特亲征。宋江兵势无人敌，国破身亡是此行。
暂且不说方腊如何分调人马去两处迎敌。先说宋江率领大队军马启程，水陆并进直奔清溪县而来。水军头领李俊等人引领水军船只从溪滩里撑驾上去。吴用与宋江并马而行商议道：“这次去攻取清溪帮源洞如果贼首方腊得到消息逃窜到深山旷野中就难以捉获了。如果要生擒方腊解送到京师面见天子就必须里应外合认得他本人才能擒获。同时也要知道方腊的去向下落以防被他逃走。”宋江说：“如果要这样做的话必须用诈降之计才能里应外合。之前柴进和燕青去做细作至今还没有消息。这次派谁去好呢？必须是会诈投降的人才行。”吴用说：“依我看来只能让水军头领李俊等人将船内的粮米诈献投降让他们不疑心。方腊那厮是山僻小人见了许多粮米船只肯定会收留的。”宋江说：“军师高见极是。”便叫戴宗传令给水路的李俊等人告诉他们如此如此行事。李俊等人领了计策戴宗自回中军去了。
李俊随即命令阮小五、阮小七伪装成船夫，童威、童猛则扮作随行的水手，他们驾驶着六十只粮船，船上都插着新换的献粮旗帜，从大溪里一路驶上清溪县。当他们接近清溪县时，看到上游早有南国的战船迎面驶来，敌军纷纷放箭射击。李俊站在船头大声喊道：“不要放箭，我有话要说！我们都是来投降的人，特意将粮米献给贵国，以接济军士，希望你们能收留我们。”对面船上的头目看到李俊等人的船上并没有军器，因此就没有继续放箭，而是派人过船来询问详细情况。他们查看了船内的粮米之后，便去报告了娄丞相，禀告说李俊等人献粮投降。
娄敏中听了报告后，便叫人传唤投降的人上岸来。李俊登岸后拜见了娄丞相。娄敏中问道：“你是宋江手下的什么人？担任什么职务？这次为什么来献粮投降？”李俊回答道：“小人姓李名俊，原是浔阳江上的好汉，曾在江州劫法场救了宋江的性命。但现在宋江受了朝廷的招安，做了先锋后却忘记了我们之前的恩情，多次羞辱小人。现在宋江虽然占领了大国的州郡，但他手下的弟兄已经逐渐折损殆尽，他仍然不知进退，还威逼我们这些水军向前。我们实在受不了这种屈辱，所以特地将他的粮米船只私自献来投降贵国。”
娄丞相听了李俊的这一番话后深信不疑，便带领李俊去大内朝见方腊，详细禀告了献粮投降的事情。李俊见到方腊后再拜行礼并奏报了之前的事情。方腊对李俊的话坦然不疑并加封他为水军都总管之职；阮小五、阮小七、童威、童猛都被封为水寨副总管并负责在清溪管领水寨守船。方腊还承诺在击退宋江军马后回朝时会另有赏赐。李俊拜谢后出宫自去搬运粮米上岸进仓交收。
有诗为证：神机妙算擒方腊先遣行人假献粮；指日可待宋军平定大内清溪的花鸟也将变得凄凉。
再说宋江与吴用分调军马后派出关胜、花荣、秦明、朱仝四员正将为前队引军直进清溪县界正好迎上了南国的皇侄方杰。两军各自列好阵势后南军阵上的方杰横戟立马杜微则步行跟在他身后。杜微浑身披挂铠甲背后藏着五把飞刀手中握着一把七星宝剑。两将出阵后宋江阵上的秦明首先出马他挥舞着狼牙大棍直取方杰。方杰也不搭话两将便开始交战。方杰年轻气盛精神抖擞那枝戟使得出神入化；与秦明连斗了三十多个回合依然不分胜负。方杰见秦明武艺高强也施展出自己平生的学识丝毫不给他喘息的机会。当两人斗到紧要关头时秦明也发挥出了自己的全部实力让方杰无法找到突破口。然而就在这时杜微却突然从马后闪了出来他掣起飞刀朝秦明的脸上飞去。秦明急忙躲避飞刀却被方杰趁机一戟刺下马去当场身亡。可怜霹雳火秦明也落得个横死的下场！方杰一戟戳死了秦明后却不敢继续追击过对阵的宋兵。宋兵的小将们急忙用挠钩将秦明的尸首钩过来。宋江得知秦明阵亡的消息后大惊失色一面命人准备棺椁将秦明盛殓起来一面再调遣军将出战。
方杰得胜后，在阵前高声叫嚣，要求宋兵再派出好汉与他交战。宋江在中军听到消息后，急忙来到阵前。他看见对阵方杰背后就是方腊的御驾，摆开了阵势。方腊虽然只是草头王，但他的装扮却十分华丽，显然是为了显示自己的威严。
南国阵中，方腊亲自监战，看见宋江亲自出马，便派遣方杰出战，想要捉拿宋江。而宋兵这边也准备迎战，想要擒获方腊。然而，就在南国的方杰准备出阵时，却突然传来了消息，说御林都教师贺从龙总督的军马去救歙州时，被宋兵的卢先锋活捉了过去，军马已经溃散，宋兵已经杀到了山后。
方腊听到这个消息后大惊失色，急忙传下圣旨收军，保护大内。方杰只好暂时委派杜微压住阵脚，等待方腊的御驾先行撤退。方腊的御驾回到清溪州界时，却听到大内城中喊声连天、火光遍地、兵马交加。原来是李俊、阮小五、阮小七、童威、童猛等人在清溪城里放起火来制造混乱。
方腊见状急忙调动御林军马去救城中火势并与宋军进行混战。宋江的军马看见南兵退去后也随后追杀过去。当他们赶到清溪时看见城中火起便知道有李俊等人在里面行事于是急忙命令众将招起军马分头杀入城中。此时卢先锋的军马也过了山两路宋兵会合一处对清溪大内发起了四面夹攻。
宋江等诸将四面八方杀入城中各自去搜捉南军很快就打破了清溪的城郭。然而方腊却得到了方杰的引军保驾防护成功地逃入了帮源洞中。宋江等大队军马随后杀入清溪县中众将一路杀入方腊宫中搜刮金银财宝并放起火来把方腊的内外宫殿尽数烧毁府库钱粮也被搜索一空。
宋江与卢俊义的军马在清溪县内会合并聚集众将来请功受赏。在整点两处将佐时发现长汉郁保四、女将孙二娘都被杜微的飞刀所伤致死；邹渊、杜迁在马军中被践踏而死；李立、汤隆、蔡福则因重伤不治而亡；阮小五也在早前在清溪县被娄丞相所杀。此外还擒捉了南国伪官九十二员等待进一步的处理。
然而在这场混战中却不见了娄丞相和杜微的下落。宋江一面出榜文安抚百姓一面将活捉的伪官解赴张招讨军前斩首示众。后来有百姓报告说娄丞相因为杀了阮小五后见大兵打破清溪县无路可逃便在松林中自缢而死；而杜微则躲在他原来养的娼妓王娇娇家中被她的邻居举报并献了出来。宋江赏了那个邻居后令人先取了娄丞相的首级再叫蔡庆将杜微剖腹剜心用他的血来祭奠秦明、阮小五、郁保四、孙二娘以及所有在清溪战中牺牲的将士们。
处理完这些事情后宋江亲自拈香祭赛了天地和阵亡的将士们。第二天他与卢俊义一起率领军马直抵帮源洞口将洞口团团围住准备一举拿下方腊。然而方腊在帮源洞中坚守不出宋江和卢俊义虽然围住了洞口却无计可施无法攻入洞中。两军就这样僵持了数日之久。
方腊在洞中如坐针毡也同样无计可施。正在他忧闷间忽然看见殿下锦衣绣袄的一大臣俯伏在地向他启奏道：“我王臣虽然不才但深受主上的圣恩宽大无以为报。臣凭借平日所学的兵法和武功愿意借主上一支军马去与宋江相持立退宋兵中兴国祚。不知主上意下如何请赐诏旨。”方腊听了大喜便传下敕令尽点山洞内的兵马让这位大臣带领出洞去与宋江交战。然而这场交战的胜败如何我们暂时还不知道只能先期待他的威风出众了。