当时间过去40年，黄昏别馆迎来了新的客人，为了揭开40年前遗留的字谜，来寻找藏于馆内某处的宝藏。字谜的全文是“两名旅人仰望天际之夜……恶魔降临城堡、国王携宝潜逃……王妃泪洒圣杯、祈求原谅，士兵持剑自裁、血染遍野……”
事情要从小五郎带着柯南和小兰在开车去委托人家的途中爆胎了，小五郎看见远方有加油站就跑了过去换好装备后再次向着目的地出发，结果在树林里遇见一个人
“婆婆你在这个地方做什么”柯南好奇询问在路中间拦车的老人
“你们看到了我的车子发不动了，所以我才会在这里等人经过，你们也是去黄昏别管的吗”婆婆走到窗边询问
毛利小五郎看了看她最后还是点了点头，车上他们聊了很多，不久几人终于来到了黄昏之馆，屋里的庸人招呼好几人以后再次去忙了
“那个人好像是…”一位绿色西装的男子看着对面那位白色西装的人
“他是美食家侦探大上祝善”小五郎看着眼前人说道
庸人不知和大上祝善说了什么让他突然大叫
“什么厨师病了不能做菜，可是我们当初不是这么说的，我可是为了这顿晚餐才大老远来到这里的”大上祝善双眼瞪大不可置信的看着庸人
“这真的不好意思，我已经把要用的吃材买好了”庸人一脸抱歉
“好吧！你不用再说了那么厨房就交给我吧，我自己做毕竟世界上只有美食和杀人案，才能让我的脑世胞快速活动”大上祝善说完转身离开
这时庸人转头对着小五郎几人抱歉，因为刚刚的事情怠慢了几人
“你的主人是什么意思，把我们四大名侦探请来一定有事情吧”千间降代询问庸人
“没错不过这次请来的名侦探，包括你们在内一共有六位”庸人说道
这时茂木遥史有些不满的看着庸人
“拜托！除了我们还有其他两个是谁”茂木遥史看着庸人
“没错！他们是一位小姐和一名少年”庸人回答
“难道是新一回来了”小兰问了一句
这时柯南不断在心里吐槽
“我想可能是平次哥哥吧”柯南来了一句
这时庸人表示不是新一，因为工藤新一一直联系不上，至于腹部先生因为最近要期中考试直接被她母亲拒绝他参加，所以主人取消了两位的名单，与此同时毛利先生说他要带两位家人来，我向主人报备经过主人同意才可以”庸人回答柯南和小兰的问题
“你们哪一位很喜欢侦探的主人在哪里？”茂木遥史看着眼前的庸人询问
庸人一脸不好意思的看着眼前的各位
“其实现在就连我也不知道主人在哪里”庸人一脸歉意
听到她的话小五郎就感到奇怪
“他不是给了你名单吗”小五郎看着庸人
突然庸人想起了什么
“对了名份名单的却在女佣面试的时候就已经拿到手，可是那一场面试实在太诡异”女佣回想起之前的面试
“诡异！”小五郎不解
“我是石原亚纪，因为这份工作的待遇非常好，所以来这里应聘的人非常踊跃，但是当我走进面试的房间之后却发现房间里只有一台电脑，还有一份晚班说明除此之外桌面上还有一份名单，无奈之下我只能按着名单里的要求做，不多时电脑显示我以被录取”石原亚纪回想起之前面试发生的诡异过程
“这么说那个时候你也不知道为什么被录取”小兰一脸疑惑的看着石原亚纪
只见石原亚纪点了点头
“可是你应该可以听到什么声音才对，你不是要得到主人的允许我们要求吗”小五郎一脸不解的看着石原亚纪
“老师说比较细节的问题，我跟主人都是透过行动电话上的电子邮件沟通的”石原亚纪说道
听到石原亚纪的话所有人都感觉到非常奇怪，突然千间降代笑了笑
“这还是很有意思的，我突然感觉自己有点兴奋”
“其实我在看到门上那个诡异的把手就已经很兴奋”茂木遥史有点期待
听到茂木遥史的话小兰看向门把手，发现把手真的很奇怪
“这个到底是怎么安装进去的”小兰在研究把手
这时茂木遥史看着好奇宝宝一般的小兰还是提醒了一句
“小心点，这个有可能是历史遗留下来的血迹”
这一下成功把小兰吓得远离把手
“讨厌！你是开玩笑的对吗”小兰看向茂木遥史
“他说的都是真的”这时一名身穿白袍的女人正在带着手套消毒面前的楼梯检测血液反应，不多时结果出来了除了门把手上有血液反应，现在连楼梯也有血液反应而且还发现地板也有
“虽然经历了时间的洗礼，可是血液是永远洗不掉，看来这些血迹的主人不一般”女人说道
“说的好！”一名年轻的男子走出来
柯南认出了那个男子
“哥哥你是不是白马探！”柯南一脸天真的看着走出来的人
“柯南你认识他”小兰一脸好奇
听到柯南叫自己白马探也好奇的打量柯南
“小弟弟你认识我！”白马探有些诧异
这时毛利小五郎也凑了上来
“他是谁！”小五郎小声询问
柯南一脸不认识的表情看着毛利小五郎和小兰
“白马探英国留学生，高中生侦探其父亲是警视厅警视总监”柯南解释道
听到柯南的回答白马探一脸兴奋
“小弟弟没想到你对我这么了解”白马探现在自恋的以为自己已经很出名了
谁料到柯南给了他一个白眼
“你的资料啊度啊科全部有齐”柯南举起手机的搜索页面递给他看
看到柯南的操作白马探立刻被打击到了，接下来的时间几人都在进行娱乐活动，直到晚饭的时候所有人都聚集在大厅，这时这座黄昏之馆的主人也来到了大厅里面，所有人只看见一个身穿紫袍的身影坐在主位置上，所有人这个时候才看见了主人出现
在所有人落座之后主人开始说话了
“这次找各位前来黄昏之馆的目的是，主要想各位帮助我把目前这座馆里面其它地方的宝藏挖出来，我花了很多年才聚集到这笔财富，就算拼了命我也要得到这笔财富”主人说道
“财富！”毛利小五郎惊讶了
就在这时窗外传来爆炸声
“什么声音”大上祝善站了起来看向窗外
结果发现他们开来的车子全部发生爆炸
“你要困我们在这里！”白马探看向主位的人
就这样六位名侦探外加小兰和柯南就被困在了这个充满诡异的黄昏之馆，在这里会发生什么事情呢，在场的所有人都陷入谜团