面对米国飞机的疯狂进攻，“祥凤”号躲进了由护卫它的驱逐舰组成的防护圈之中，同时起飞了自己所搭载的全部21架飞机，开始拼命地顽抗。
“瑞鹤”号和“翔鹤”号两艘倭国航母，在接到了“祥凤”号突然遭到米国航母舰载机攻击的消息之后，开始紧急回收起飞的飞机，准备返回图拉吉岛附近参加战斗。
因为天气恶劣的原因，航母想要回收飞机并不是一件容易的事情。两艘倭国航母花了将近两个小时的时间，才把自己的飞机回收完毕，开始转向急速向图拉吉岛方向驶去。
只不过到了这个时候，“祥凤”号已经身中14发航弹和2发鱼雷，沉进了大洋之中。
与它同行的倭国战舰也损失惨重，两艘鱼雷舰和一艘驱逐舰被炸沉，其余的也基本上个个带伤。
弗莱彻在收到出击返回的飞行员报告，确认已经炸沉了一艘倭国航母之后，马上下令停止进攻，尽快撤离珊瑚海海域，以防止被倭国舰队的主力报复。
但此时他们的踪迹，也已经因为自己的进攻而暴露在了倭国海军的眼中。
在接到“祥凤”号沉没的消息之后，暴怒的井上成美命令“瑞鹤”号和“翔鹤”号两艘航母沿着弗莱彻他们撤退的方向紧追不舍。
一直率领倭国联合舰队主力埋伏在中途岛和所罗门群岛之间航线附近的山本五十六，也在一直没有等到米国舰队前来的情况下，决定先回头包抄弗莱彻这支小舰队，把米国的两艘航母吃下来再说。
6月6日下午2点左右，“约克城”号和“列克星敦”号终于在萨布岛附近海域，被从“瑞鹤”号起飞的一架倭军侦察机发现，不过这架侦察机很快就被负责警戒的米国战斗机击落。
但此时米国这支舰队的位置，已经被倭国侦察机使用无线电发了回去。
井上成美害怕这些好不容易被找到的米国船再次溜掉，不顾天色将暗，便迫不及待地命令两艘航母上的飞机全部起飞前去攻击米国舰队，自己的所有战舰也都把速度提到最高，紧追在后面，以便尽量减少飞机返回降落时的航程。
弗莱彻在得知倭军侦察机出现在自己舰队上方之后，明白自己的位置已经暴露，同样也下令自己航母上面的飞机做好起飞准备，随时应付倭国飞机的袭击。
一个小时之后，随着大片的倭军飞机到来，萨布岛的上空爆发了一场声势浩大的空战。
双方将近300架飞机缠斗在一起，海面上米国的众多战舰也在拼命开火，几乎每过一两分钟，就会有飞机拖着黑烟一头扎进大海之中。
米国大部分的飞行员都是之前没有参加过实战的菜鸟，远不是经验丰富的倭国战斗机飞行员的对手，所以很快就损失了大批的飞机，逐渐被压制住。
倭国的俯冲轰炸机和鱼雷机开始跟着进场，瞄准了两艘巨大的米国航母开始攻击。
雨点一般的航空炸弹开始落在“约克城”号和“列克星敦”号的四周，炸起一根根十几米高的水柱，一条条鱼雷也在海面上拖着银线，直奔两艘航母而来。
米国的两艘航母开足了马力左躲右闪，四周的护卫船只也在不停地为他们提供掩护，甚至直接用自己的船身阻挡奔着航母而去的鱼雷。
等到倭军的飞机弹药耗尽，开始纷纷返回自己的航母补充油料和弹药的时候，米国的两艘航母已经各自中了3发炸弹，甲板上被炸的一片狼藉。整个舰队更是被炸沉了1艘驱逐舰和2艘运输船，重伤了其余的2艘。
不过米国海军的损管技术确实比较过硬，很快就将航母的甲板给清理了出来，破损之处也迅速地修理完毕，这才使得一直停留在空中的自家飞机有机会陆续降落下来。
更加幸运的是，有一架米国的侦察机悄悄地跟着返航的倭国机群，找到了倭国舰队的位置。
弗莱彻顾不上心痛自己的损失，一边命令舰队马上改变航向，尽快远离现在的战场位置，一边命令回收的飞机改挂鱼雷和炸弹，然后重新起飞绕了个圈子去攻击倭国的舰队。
等到下午4点半的时候，米国的攻击机群来到了倭国舰队上空，开始对“瑞鹤”号和“翔鹤”号发起了进攻。
因为第一轮攻击的效果不错，打算乘胜追击的井上成美命令回收的机群用最快的速度补充了燃料和弹药，然后再次起飞前去发动第二波攻击。
为了能赶在太阳落山之前一举建功，井上成美连保护己方舰队的战斗机都没有留下多少，几乎全部派了出去。
结果就是等米国的大批飞机来临的时候，倭国的舰队根本没有足够的飞机保护，同样被炸了个稀里糊涂。
瑞鹤号挨了三枚重磅炸弹，翔鹤号挨了一枚炸弹和一发鱼雷，虽然都没有击中要害部位，但也各自都受了不轻不重的伤。
倭国出击的机群也没有扑空，虽然弗莱彻及时地命令舰队进行了转移，但两艘因为重伤速度降至只有几节的舰船却因为拖在后面，而被倭军四下搜索的倭军战斗机发现，进而沿着他们前进的方向发现了正在疯狂逃窜的米国舰队。
同样缺乏战斗机保护的米国舰队在随后蜂拥而至的倭国飞机围攻之下，伤亡惨重。
两艘驱逐舰为了保护自己的航母被鱼雷击中当场沉没，约克城号航母的甲板几乎被完全摧毁，列克星敦号更是因为动力舱被一颗重磅航空炸弹命中，丧失了80%以上的动力，速度降至不足3节。
随着夜幕的降临，双方被迫各自停战。
返回的米军机群因为自家的两艘航母都丧失了回收战机的能力，被迫飞往袋鼠国的机场降落，但大半的飞机都因为油料耗尽而掉进了大海之中。
倭国的飞机也因为返回自家舰队时时太阳已经落山，被迫在探照灯的指引下进行夜间迫降，累计损失了十几架飞机。
山本五十六在接到战况报告之后，率领倭国的主力舰队在袋鼠国前往米国西海岸方向的航线上拦截搜索了足足3天，试图全歼这支米国舰队，但却一直它们的踪迹。
事实上，为了不被倭国人的舰队追上自己，弗莱彻当天夜里就命令用鱼雷击沉了包括列克星敦号航母在内的4艘近乎彻底丧失动力的战舰，然后趁夜色逃往了南美洲的瓦帕索港，从而避开了倭国舰队的搜索拦截。
此战结束之后，倭国的瑞鹤号和翔鹤号航母返回倭国本土进行大修，山本五十六则率领舰队主力回转珊瑚海，协助陆军的登陆部队顺利地攻占了所罗门群岛几乎所有主要岛屿，并且彻底占领了新几亚岛的莫尔兹比港。
等到了7月份的时候，倭国已经几乎占领了袋鼠国大陆周边几乎所有重要岛屿，彻底切断了袋鼠国与美洲之间的联系。
在经过了一番激烈的争论之后，山本五十六获得了倭国天皇的默许，暂缓了协助陆军登陆袋鼠国大陆的计划，开始率领倭国的庞大舰队朝米国的西海岸方向挺进，打算把米国的太平洋舰队逼出来进行决战，彻底解决这一隐患，然后再回头攻占孤立无援的袋鼠国。
接下来的一个月时间里，倭军联合舰队连克淄鲁岛、马绍尔群岛、关岛等米国在太平洋上的重要据点，并且占领了米国主动放弃的中途岛，兵锋直指欧胡岛所在的夏威夷群岛。
而这时在无数米国造船厂工人的日夜赶工下，两艘埃塞克斯级航母，“埃塞克斯”号和“无畏”号，终于先后下水。
为了节约时间，尼米兹命令把这两艘航母正常情况下需要至少数个月时间的附属设备的安装、人员培训和试航全部压缩到了一起，不惜冒着造成损失的风险，也要在最短的时间形成战斗力。
这时被从南美洲拖回西海岸的“约克城”号，也已经紧急维修完毕，加上太平洋舰队原本剩下的企业号、萨拉托加号和大黄蜂号，米国在西海岸已经拥有了6艘航空母舰。
加上欧胡岛和西海岸各处机场里的大批陆基飞机的支援，此时的米国太平洋舰队，已经有了和倭国联合舰队一决胜负的实力。