直到过了半个月，蒙面的男子再次出现，打开铁门：“你可以走了，你不是纪家的人，我不会乱杀人的，走吧。”方溪看了蒙面的男子一眼，然后，拔腿就走，出了老宅，方溪看了一下自己所在的位置，往集市走去，来到一家当铺，把身上的簪环首饰全部挡掉，当了五十两银子，方溪换了身男装，把衣服也当了，问了一下路，动身往扬州方向离去，方溪不知道的是，那个蒙面的男子一直派人跟踪她，原来，他查了很久也查不到线索，只知道纪家大小姐确实不在家，去哪了不知道，但肯定没被人抓走。
纪家的男丁已经全被他杀光了，只剩这个女儿，绝不能留。直到后来，纪夫人收到一封信，被男子截获了，上面写着：女儿一切都好，现已平安抵达广州，母亲勿念。男子这才知道，原来纪小姐在广州。转身，就放了方溪，但是，他担心方溪会泄露她知道的事，所以，偷偷跟踪，并嘱咐手下：万一她要是回纪家，就在纪家门口把她杀掉，不能让她泄露秘密。直到确认方溪没回纪府，跟踪的人才离开。
且说方溪一路颠簸，有时搭一下顺风车，一个月以后终于到扬州了，方溪拿着香囊去娘说的寺庙，找到了太师父淳于思德，太师父可怜自己唯一的女徒弟死了，只有这么个养女，索性，带她去城里一家杏林居药铺，让自己的徒弟，白俊梅的师兄，收方溪为徒，自此，方溪就成了一个药铺的学徒，因为方溪小的时候，母亲是用汤头歌、千金方等医书教她识字的，所以，方溪在药铺上手很快。
每天，方溪都是早早起床，收拾铺子，打扫卫生，然后做早饭，吃过早饭以后，就开始按药方抓药，把药全包好之后，等病人来取药。她不会把脉，师父也没想教她，说是这个世道，女子活着本就不容易，万一有人说什么男女授受不亲，为难方溪怎么办？“可是，我娘是医女啊？”方溪问道。“你娘是通过官府考上的医女，以前在宫里专门给那些得病的宫女治病，皇宫可不是一般的地方，除了宫女就是太监，当然没人说闲话了。”“那我不能去考医女吗？”方溪问道。师父摇头：“千万别去，那里边不是人待的地方，怎么死的都不知道。”无论怎样，师父都不想让方溪走她娘的老路。方溪也只好放弃了，不过，医学可不止有把脉这一样：拔罐、种药材、针灸、熬治药膏、妇科甚至还有外科手术。这么多，选哪一样都可以呀。
师父把一块园子交给方溪，让她没事种点药材，当然，不是随便种的，方溪种的药材，都是那种使用的时候，需要新鲜使用的药材，比如佛手，止血的时候就需要割下新鲜的佛手，把挤出的汁水涂在伤口上，立刻就能让血凝固住。还有大葱、生姜等也是要新鲜的入药、除了种药材，方溪还养了许多乌骨鸡，每天都用药铺煮剩的药渣来喂它们。“师父，我想养一些鸽子。”方溪跟师父说。师父却摇头：“鸽子容易被其它的鸽子带跑了，养不住，你还是别养了。”方溪点点头。
这样时间过的很快，一晃就是几个月，方溪学的很认真，进步很大，师父还教她熬膏药。方溪很仔细的掌握火候，不但熬出来的膏药特别纯，药效也好，而且，能在没有人指点的情况下，单靠医典上的药方就熬制出很珍贵的药膏。师父很高兴，连连称赞：方师妹，你后继有人了！在药铺工作的时候，方溪认识了街坊邻里的孩子，和他们成了好朋友。“方溪，快跟我来。”王二狗突然跑来喊方溪。“怎么了？”方溪问。“李双双在河边抓螃蟹，不知道被什么东西把手扎了，这会儿整只手已经肿起来了，没知觉了。”方溪一听就明白了，当即去药铺拿了几颗药丸，然后，跟王二狗一起往河边跑去。刚走过去，就听见李双双的哭声：“好疼···呜···呜···。”方溪走过去，先看了一下她的手，然后，从兜里摸出药膏，打开盖子，一股好闻的香味扑鼻而来，用手指挖出一小坨药膏，慢慢的涂在李双双的手上，又把药丸喂给李双双。不一会儿，李双双就停下了哭声：不疼了。她的手此时感觉凉丝丝的，已经有些消肿了。等到李双双的家人赶来的时候，李双双的手基本已经没什么大碍了。很快，周围的小孩就都知道：方溪的医术好厉害。
一晃一年过去了，这天，方溪到城外山上采药，意外的在树林发现一个人。“喂，你怎么样？”方溪发现他的腰上中了一剑，正在流血，当即碾碎了草药敷在伤口上，血很快就止住了，又找人帮忙把他背回了药铺，救治了半天，总算把命救回来了。当他醒来，看见方溪：“是你救了我？”“是。你别乱动，你的伤刚包扎好，我去给你拿点吃的。”方溪转身给他拿来一些小包子和田鸡粥，男子饿坏了，吃了十个包子，喝了三碗田鸡粥。“你叫什么？。”“萧磊”男子回答道。“你先在这养伤，我去忙了。”此时的方溪，完全没有认出自己救的这个人就是山洞里的黑衣男子。男子却认出了她，但他却假装不认识方溪。接下来的一段时间，萧磊一直在药铺养伤，在方溪的照料下，他的伤好的很快。当他的伤好了以后，把自己的贴身玉佩送给了方溪，转身离去了。