弘光七年七月一日，朱由崧经辽西走廊回到山海关内，随即继续西进，并于20天后再临大同。
当年八月一日，西征京营等部在大同完成了10天的休整后，会同宣府、大同、偏关三军抽调而来的4个骑兵师、4个骑兵团、2个骑马步兵团、3个边军辎重团经右玉出关，并在尚未移封的察哈尔诸卫及土默特诸卫兵马的引导下经和林格尔抵达了黄河边上的托克托和萨拉齐。
随即，出击明军在及时赶来的黄河水师同州团的运输下，成功越过黄河，杀入了鄂尔多斯境内。
由于事发突然，鄂尔多斯各部根本没有想到明军会从黄河北岸杀出----在鄂尔多斯人看来，明军应该是从榆林、宁夏方向发起进攻的----因此被明军打了一个措手不及。
经过一个月的鏖战、追击，在察哈尔人、土默特人的协助下，明军共击毙鄂尔多斯骑兵（牧民）逾8000人，俘虏另外3000多骑兵（牧民）并俘虏了余鄂尔多斯部的妇孺，解决了之前历年中被鄂尔多斯人掳走的余陕西百姓。
在明军的猛烈打击下，鄂尔多斯六部首领博硕克图额磷臣被迫向朱由崧请降，朱由崧遂封六部首领为郡爵，并将其等全部安置在北京城居住，并将鄂尔多斯六部重新划分成为由明廷直接委任掌卫事管理的五个卫。
随后鄂尔多斯五卫又被迁移到了饶余都司、松漠都司境内安置，而鄂尔多斯故地及另一时空乌兰察布盟境内，则另外安置了卜罕、坚河、屯河等九个卫。
鄂尔多斯人的下场，吓坏了在甘州附近游牧的阿拉善人，这些阿拉善人主动向朱由崧请降，于是被分为三卫，安置在宁夏以北、黄河以西、河西长城东北地域。
于是，截止到弘光七年九月十三日，松漠都司共下辖19卫、1个千户所级别的活佛供养地，饶余都司则下辖21个卫，朔方都司地盘虽然一样不小，但由于境内有多处沙漠，所以只下辖了12个卫----几年后饶余都司迎来了一批逃难的喀尔喀人、几十年后朔方都司名下又来了东归的土尔扈特人，所以两个都司后来还有调整，但这是后话了----至此，漠南算是初步安定下来了。
既然漠南算是初步稳定了，那么各路边军的兵力就不需要继续保留那么多了，所以朱由崧便在率部南返的路上，对偏关、榆林、宁夏、河西、西宁等边军部队做了相应的裁剪。
裁剪后，偏关军编入宣大军序列；榆林军和宁夏军实现合并；河西军与西宁军实现合并。
由是，明军在北方防线上，形成了前后三道阵线：第一道是由三都司的驻防军构成的前方警戒线；第二道是由辽东军、蓟州军、宣大军、狭北军、甘肃军组成的主力迎击线；第三道则是由顺天府、河南府、固原州境内的京营组成的预备反击线。
当然，这三条线目前来看还比较单薄，但真要遇到大规模入侵的话，未必不能发挥应由的作用----爆发战争的北边各道也能在第一时间出动内镇兵马协同守备和迎击。
随着三条防线的构成，边军总数将从最高峰的人，削减至人----辽东军、蓟州军、宣大军将保留人、陕北军、河西军----内镇兵马总数将从人增加至人，合计裁兵四万整，将极大的减轻国库支出压力。
但这不算完，朱由崧预备过几年后，根据国家总体形势，进一步削减内镇兵马人数----与另一时空的清朝不同，眼下的大明不用防老百姓跟防贼一样，只要不再出现大规模的流民起义，各地镇戎兵马却是不用那么多的----第一期预计将削减2万人左右，十年内将再削减2~3万人，最终内镇兵马总数将重新控制在18万上下，以节省浩大的军费开支。
当然，再怎么减少国内军队，京营是不会削减的，相反，若是情况允许，朱由崧还会进一步增加京营的数量，以方便日后的各种远征······
“皇爷！”等朱由崧再次回到北京时，万世向他报告道。“红毛夷通过福海号驻巴达维亚商馆向朝廷提出抗议，抗议朝廷将淮藩封在巨港、将邾藩封在西婆罗洲！”
“真是一波未平一波又起啊！”
朱由崧原本计划要痛打建虏和科尔沁人的，结果两部大都逃了；朱由崧原本计划在消灭建虏后，攻打菲律宾的，结果阮主又跳出来了；朱由崧又计划夺取安南，重新规划交趾半岛局面，结果高平莫氏不愿意引狼入室，而荷兰人又出来搅局；所以，计划不如变化，穿越者也不能事事如意啊！
“既然红毛夷挑事，那么下打红毛夷吧！”
朱由崧算了一下，如果不出现大的蝴蝶效应，现在英国人应该已经跟荷兰人闹上了，面临第一次英荷战争即将爆发的前景，朱由崧判断，荷兰人应该已经开始向本土收缩力量了，所以，现在是解决荷兰东印度公司最好的机会！
“命令三洋水师，立刻调动战船兵员，先拔了赤坎城，拿下小琉球南部。”朱由崧如此决定道。“再命令琼州水师，立刻进驻龙牙门周边海域，封锁马六甲海峡并盯防巴达维亚方向。”布置完作战任务，朱由崧看向万世。“西厂能策动巴达维亚的大明移民反抗红毛夷统治吗？”
万世想了想，答道：“难度很大，但奴婢可以尝试一下！”
朱由崧点点头：“那就安排下去吧！”
万世应了一声，去安排了，朱由崧坐在宫室里想了许久，传唤道：“让顾波来见朕！”
名为乾清宫管事太监、实际是朱由崧贴身内侍头领的顾波很快出现在朱由崧面前：“你当任乾清宫管事已经很久，朕想抬举你，且去一趟琼州，跟南安县侯传几句话，做好了，朕升你为直殿监监督、司礼监随堂！”
顾波应道：“奴婢愿为皇爷赴汤蹈火！”
“这还不至于！”朱由崧冷冷的说道。“你去了琼州，问郑芝龙想办法自开一藩·······”