对于应天作为帝都，朱元璋始终有些不满意，他的理想的都城之地是老家濠州或是古都长安、洛阳、开封建都，当然，大都（北京）也在考虑范围内。然而，不怕不识货，就怕货比货。长安、洛阳两地，久经战火，早已破败不堪，要重修建都，耗费极大，而在濠州，中都的修建耗费极大，大臣们都反对，百姓也有意见，甚至因此而发生起义。不得已停止了修建，至于开封，好是好，城池坚固，在北宋、金、元时期发展很繁荣，遗憾的是不易防守，而且由于地势低，有洪水的威胁。北京是故元之都，元朝新亡，建都于彼，君臣皆以为不吉利。所以他才勉为其难，定下应天为都城。
虽说已经早昭告了天下，但心中对应天仍旧不满意，在他看来应天做为都城，有三处困扰着他，一是中原的局面一直在北方，建都南京有偏安性质；二是元朝残余势力仍虎视中原，伺机南下，建都南京有鞭长莫及的感觉；这两处倒也罢了，毕竟可以慢慢改变，唯独第三个隐患，让他心中着实不安。
应天就修建宫殿而言，的确比中都，汴梁差了许多，燕雀湖地势低洼，又距离外城太近，战时易受城外敌军威胁，并非理想的地点。但军师刘伯温判断此地为“龙头”宝地，对于刘伯温的能耐，朱元璋深信不疑，不得不在此修建新宫，为了修建新皇宫，他调集几十万民工填湖。由于湖广势低，填湖工程十分浩大，需要大量的土石，故南京民间有“迁三山填燕雀”的传说。燕雀湖大部分被填平后，为了防止地基下沉，又在殿基下打入无数密集的木桩，上盖巨型条石，然后再在上面建造宫殿，并铺盖砖石结构的大型水道。为了使内宫水源澄清，又在遗留的湖底铺以大量雨花石，让湖水穿城墙而入，在内宫屈曲环绕。便是这样，朱元璋认为这破坏了风水，对子孙后代不利。所以，他一直想迁都。迁往何处？他心目中认为长安较好，长安有函谷关、陇蜀的沃野千里，南边有巴蜀的富庶，北边有胡人畜牧的便利，可以在三面防守，并向东方牵制诸侯，只要握住渭水通运京师，当东方有变，就可以顺流而下。正所谓金城千里，天府之国。是最为理想都城，可眼下天下尚未统一，迁都之事不是小事，需要从长计议，这才是他没有迁都汉中的缘由。
“陛下——？”一个太监看着朱元璋紧皱的眉头放了下来，这才小心翼翼的弓着身子走了上前，叫了声。
朱元璋端坐在龙椅上，随手端起茶几上的茶杯押了一口茶，眼皮抬了一下，道：“何事？”
那太监一副如临大敌的模样，战战兢兢的道：“回，回禀陛下，大元帅送上了谍报，相国大人派人送进了宫中！”
“谍报，在哪里？”朱元璋一惊，腾了一下站了起来。
那太监吓了一大跳，更加担心的道：“回禀陛下，在奴才这里？“
“拿过来！”朱元璋喝道。
“是！”那太监急忙送上谍报。
朱元璋没有急着翻开谍报，而是扫了一眼那太监，从鼻腔里冷哼了声，道：“这谍报你从何处得到？“
那太监心头一惊，随即汗流如雨下，颤声道：“奴才今早收拾陛下书房时，恰好看宫中锦衣卫送来谍报，奴才怕陛下忘记看了，才大着胆子给陛下送来——？”
“大着胆子？”朱元璋冷笑了声道：“你果然大胆！来人拖出去！仗责五十！“
“陛下饶命啊，奴才，奴才再也不敢了？再也不敢了？“那奴才跪倒在地，大声求饶。
朱元璋道：“昔年唐代宦官自殿中监李辅国开始掌握了军权，“宝印符契，晨夕军号，一以委之，日后宦官不但总领神策军，而且还组建牙队，最后形成专权，甚至有立废皇储之大权，唐文宗甚至称自己不如周赧王和汉献帝，宦官如此可恶，朕岂能纵容！“说道这儿，朱元璋眉头一皱，眼里射杀出一丝杀气，对着门口的锦衣卫道：“传令下去，今后我大明一朝，有太监干政者，处以斩刑！”
这一句圣旨一下，有洪武一朝，太监都不得过问政事，洪武十七年，朱元璋特意铸了一块铁牌，悬挂在宫门上。铁牌上写着：“内臣不得干预政事，犯者斩。”直到后来朱棣起兵“靖难”，刺探宫中事，多以建文帝左右为耳目，许多宦官立过战功。如狗儿、李兴、郑和、马靖等，开始受到重用。“盖明世宦官出使、专征、监军、分镇、刺臣民隐事诸大权，皆自永乐间始。”虽然宦官参与了不少政治活动，但还没有达到专权的程度。到明英宗时，开始形成宦官专权的局面，朱元璋太监不得干政如一纸空文，明朝的太监形成了独特的局面。这个是朱元璋无法预料的。
^^^^^^^^^^^^^^^不好意思，不是凑字数，这些都不要钱的，说两段小故事！呵呵——
传说南京城及皇宫建好后，朱元璋率领群臣登上紫金山，俯视都城之气派。南京城96里，13个城门，宫殿雄伟，在当时世界上也是少见的。对于在自己手中创造了这样一座宏伟的都城，太祖朱元璋很是得意，炫耀地问群臣：“我的都城建得怎么样啊？”群臣自然都是赞不绝口。唯独14岁的四皇子朱棣说：“紫金山上架大炮，炮炮击中紫金城。”朱元璋定睛一看，不禁冒了一身冷汗。原来南京都城周围山峦起伏，东面钟山，南面雨花台，北面幕府山等，一些重要制高点都在城外，这是城防的大忌。朱元璋心中恼怒，不过，当时没有发作。回宫后，他让太监给负责筹划筑城的刘基送去了一盘橘子。刘基知道皇帝怪罪自己筹划失当，送橘子是恨不得将其剥皮抽筋吃肉之意，吓得连夜逃入茅山避祸。
这当然只是传说。不过，确实有个因书写匾额惹怒朱元璋而被砍头的真实故事。
皇宫中各门匾中的“门”字末笔直下至底而没有向上的勾脚。“门”字的这种写法，始于宋朝。据说宋偏都临安后，玉牒殿失火，殿门烧光。宰臣奏说，宫殿匾额中的“门”字，末笔都有勾脚，带火笔，因此招火，将这些匾额全部烧掉方能免灾。从此以后，凡书写宫殿匾额的“门”时字末笔都直下，不勾脚。朱元璋命中书詹希原书写门匾。詹希原是明代着名的书法家，到朝中为舍人，常为宫殿公署榜题写匾额，人们以得其书为荣。詹希原写的时候，将“门”字最后一竖向内钩起稍高了一点。朱元璋看后便大发雷霆说：“吾方欲集贤，詹希原欲闭门塞朕贤路耶？”遂下令斩之。